每年從產業實力、質量效益、創新能力、綠色、集約、安全、融合水平、發展環境等方面，組織對國家示范基地發展質量進行評價，發布評價結果，以星級體現（星級越高表示發展質量越好），作為國家示范基地分級分類指導及動態管理的基礎和依據。

重點依托發展水平居全國領先地位、具有很強帶動性的國家示范基地，實施卓越提升計劃。對綜合評價結果為五星的國家示范基地，經遴選，確定為“中國制造2025”卓越提升試點示范基地，培育具有全球影響力和競爭力的先進制造基地。

對國家示范基地進行動態管理，實行退出機制。及時將退出結果通報財政部、國土資源部、環境保護部和商務部等有關部門。國家示范基地如發生重大或特別重大生產安全事故，或者發生Ⅱ級或Ⅰ級突發環境污染事件，直接公告退出，不再對其進行發展質量評價；對綜合評價結果為三星以下的國家示范基地，給予提醒、通報，責令整改；對連續兩次綜合評價結果為三星以下的，公告退出；對已授牌的國家示范基地，如發現弄虛作假，直接公告退出，并暫停所在省、自治區、直轄市、計劃單列市下一年度的申報工作。